Connue depuis le Xème siècle, la paroisse paraît dans les archives en 952 comme don de Guillaume Fier à Bras à l’abbaye de Saint Maixent.
En 992 la cure est mentionnée pour la première fois dans le cartulaire de l’abbaye.
A l’époque féodale (11ème au 13ème siècle), le village dépend du château édifié au Bois-Roux habité par la famille ROUX. Puis la famille HELIE (par mariage)
Sous l'ancien régime (16ème - 1789) ce sont les familles DALLOUE et JOUSSEAUME de la BRETECHE qui ont acheté en 1745 le BOIS ROUX sans pour autant y habiter. Le domaine fut régi par P. BERTHON
Saint Martin, qui était le troisième évêque de Tours, a donné son nom à l’église.
Entre plaine et bocage, Saint Martin-des-Fontaines est la deuxième plus petite commune de la Vendée d’une superficie de 544 hectares. Elle compte 172 habitants selon le recensement de 2023.
Saint-Martin-des-Fontaines porte bien son nom car on trouve sur la commune plus de 14 sources ou « fontaines » qui se versent dans la Smagne ou la Longèves.
Ses habitants sont des Marfontainois et Marfontainoises.
Ses terres fertiles et argileuses permettent une agriculture variée ainsi que la fabrication de briques et tuiles.
Mairie - 28 Rue de la Mairie - 85570 Saint-Martin-des-Fontaines